Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms