Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6P435 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6P435 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms