Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms