Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REEP3Q6NUK4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms