Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms