Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms