Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms