Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRMS1LQ5PSV4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRMS1LQ5PSV4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRMS1LQ5PSV4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRMS1LQ5PSV4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRMS1LQ5PSV4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms