Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47A1Q5JQC4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47A1Q5JQC4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms