Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms