Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASPRV1Q53RT3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASPRV1Q53RT3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms