Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms