Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms