Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms