Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms