Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR2Q2VWA4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms