Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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