Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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