Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms