Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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