Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIP13Q15645 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms