Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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