Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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