Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A1Q15459 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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