Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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