Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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