Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RFTN1Q14699 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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