Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BECN1Q14457 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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