Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM29Q14134 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms