Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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