Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms