Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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TUBB3Q13509 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB3Q13509 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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