Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DYNC1I2Q13409 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms