Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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