Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.842e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 GTF3C1-204ENST00000564664 933 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 ADH6-204ENST00000504257 731 ntTSL 315.28■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 SND1-202ENST00000461056 555 ntTSL 410.1□□□□□ -0.796e-9■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 AKAP1-214ENST00000575032 570 ntTSL 317.05■□□□□ 0.323e-8■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 DDX24-203ENST00000553400 618 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-7■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 DNAJA3-213ENST00000576911 1413 ntTSL 222.92■■□□□ 1.261e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.121e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 210.49□□□□□ -0.731e-7■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.321e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.961e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 315.05■□□□□ -01e-6■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 DYNC1H1-208ENST00000556139 763 ntTSL 317.87■□□□□ 0.453e-9■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-7■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-7■■□□□ 11.4
G3BP1Q13283 MCCC2-208ENST00000512218 2127 ntTSL 220.06■□□□□ 0.81e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CNP-205ENST00000486438 911 ntTSL 224.79■■□□□ 1.568e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CNP-210ENST00000592105 572 ntTSL 422.8■■□□□ 1.248e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.896e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 514.5□□□□□ -0.092e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.919e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.939e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 LEMD3-203ENST00000541171 856 ntTSL 229.62■■■□□ 2.336e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-209ENST00000486100 569 ntTSL 422.8■■□□□ 1.246e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-204ENST00000450303 496 ntTSL 321.01■□□□□ 0.956e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)19.83■□□□□ 0.766e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.56e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 217.85■□□□□ 0.456e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.386e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.376e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 GSPT1-210ENST00000568849 790 ntTSL 317.37■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-203ENST00000448428 490 ntTSL 515.79■□□□□ 0.126e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 DDX27-205ENST00000493252 825 ntTSL 314.43□□□□□ -0.16e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.226e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.236e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.256e-8■□□□□ 11.3
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G3BP1Q13283 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.566e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEC24C-206ENST00000634508 549 ntTSL 410.41□□□□□ -0.746e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEC24C-207ENST00000635550 3424 ntTSL 28.85□□□□□ -0.996e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.066e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRPF40A-210ENST00000489741 776 ntTSL 37.8□□□□□ -1.166e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 GOT1-203ENST00000489349 646 ntTSL 27.1□□□□□ -1.276e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CYP51A1-202ENST00000422867 747 ntTSL 36.56□□□□□ -1.366e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CYP51A1-205ENST00000482924 555 ntTSL 26.27□□□□□ -1.416e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 HDGFL2-203ENST00000592417 1349 ntTSL 224.81■■□□□ 1.563e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 HDGFL2-206ENST00000614903 239 ntTSL 524.62■■□□□ 1.533e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 HDGFL2-209ENST00000619255 320 ntTSL 323.9■■□□□ 1.423e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 HDGFL2-201ENST00000587016 870 ntTSL 323.14■■□□□ 1.293e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PEG3-210ENST00000600833 1558 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.546e-12■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 ACY1-204ENST00000468068 654 ntTSL 418.6■□□□□ 0.578e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 ABHD14A-ACY1-213ENST00000636264 516 ntTSL 516.75■□□□□ 0.278e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 EIF4A3-205ENST00000575957 574 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 NPEPPS-223ENST00000534807 838 ntTSL 211.23□□□□□ -0.613e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.215e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.285e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.135e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 217.24■□□□□ 0.351e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 531.95■■■□□ 2.712e-9■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.318e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.918e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CFL1-210ENST00000530945 1509 ntTSL 220.73■□□□□ 0.918e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 514.35□□□□□ -0.118e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 ETFA-213ENST00000560309 633 ntTSL 325.52■■□□□ 1.683e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 318.9■□□□□ 0.622e-9■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 IPO5-202ENST00000357602 4335 ntAPPRIS P1 TSL 514.93□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.472e-6■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-204ENST00000525616 780 ntTSL 226.6■■□□□ 1.852e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.822e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 223.52■■□□□ 1.362e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-8■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 QARS-232ENST00000634609 553 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.398e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 QARS-204ENST00000418549 558 ntTSL 416.55■□□□□ 0.248e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 QARS-227ENST00000634425 520 ntTSL 514.24□□□□□ -0.138e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 QARS-243ENST00000635494 568 ntTSL 414.08□□□□□ -0.168e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 QARS-203ENST00000417025 572 ntTSL 513.55□□□□□ -0.248e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 QARS-215ENST00000479495 577 ntTSL 410.96□□□□□ -0.658e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 227.34■■□□□ 1.974e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.524e-7■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 DEK-207ENST00000515742 661 ntTSL 228.77■■■□□ 2.23e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 COPE-207ENST00000597646 868 ntTSL 324.69■■□□□ 1.543e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 COPE-209ENST00000599964 542 ntTSL 423.59■■□□□ 1.373e-10■□□□□ 11.3
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