Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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