Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FOXC1Q12948 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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FOXC1Q12948 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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FOXC1Q12948 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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FOXC1Q12948 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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FOXC1Q12948 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXC1Q12948 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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