Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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