Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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RAB40BQ12829 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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