Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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