Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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KCNMA1Q12791 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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KCNMA1Q12791 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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