Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms