Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms