Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms