Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms