Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms