Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms