Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSME1Q06323 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms