Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC4Q03721 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms