Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms